Concluida la etapa de verificación de procesos académicos, el Consejo Superior de Educación decretó, el 18 de marzo de 1993, la plena autonomía de la Universidad, basada en el cumplimiento satisfactorio del proyecto institucional en sus primeros diez años de funcionamiento.
1992-2002: Autonomía, infraestructura, expansión de la oferta de pregrado y compromiso con el desarrollo de políticas públicas del país 